linux çekirdeği ve işletim sistemleri hakkinda temel bilgileri ve moleküler dinamik simülasyonları yürütülürken sıklıkla kullanılan komutları incelemek için "linux_temel_bilgiler" (düzenlenebilir .docx uzantılı ya da taşınabilir .pdf uzantılı) dosyayı inceleyiniz
Bu doküman(lar) güncel yapay zeka araçları kullanılarak oluşturulmuş ve tarafımca eklemeler ya da çıkarmalar yapılarak düzenlenmiştir. Yeni başlayanların kullanımına açıktır.
İlgili döküman(lar)a ek olarak ; https://www.digitalocean.com/community/tutorials/linux-commands ...
adreslerinden, yapay zeka araçlarından ya da herhangi bir internet sitesi üzerinden yapacağınız " linux en sık kullanılan komutlar // linux codes for beginners " aramalarıyla benzer bilgilere erişilebilir .
Metin işlemede en yaygın kullanılan araçlardan biri olan awk için sık kullanılan komutlar ve örnekler için: https://www.freecodecamp.org/news/the-linux-awk-command-linux-and-unix-usage-syntax-examples/
TÜBİTAK ULAKBİM tarafından Türkiye çapında açık bilim ve ilgili konularda farkındalık yaratmak, mevcut bilgi düzeyini artırmak, araştırmacıların proje süreçlerini kolaylaştırmak ve kamu fonlarıyla üretilen bilimsel içeriğin korunmasına katkıda bulunmak amacıyla planlan https://acikders.ulakbim.gov.tr/ platformu açık bilim ve araştırma verilerinin yönetimi konusunda uzman akademisyenler tarafından hazırlanan çok kıymetli eğitimler içermektedir. Bunlardan bazıları;
High Throughput Virtual Screening with the AutoDOCK Vina Program (Sefer Baday (İTÜ)): https://acikders.ulakbim.gov.tr/course/view.php?id=27
Molecular Dynamics Simulations of Small Molecules (Tandaç Furkan Güçlü (Sabancı Üni.)): https://acikders.ulakbim.gov.tr/course/view.php?id=28
Molecular Dynamics Simulations with LAMMPS (Hande Toffoli (ODTU)): https://acikders.ulakbim.gov.tr/course/view.php?id=26
Başlangıç Düzeyinde Süper Bilgisayar Kullanımı (Ahmet Tuncer Durak (İTÜ)): https://acikders.ulakbim.gov.tr/course/view.php?id=32
python aracılı uygulama eğitimleri https://pdb101.rcsb.org/train/training-events
BioEmu run in one https://colab.research.google.com/github/sokrypton/ColabFold/blob/main/BioEmu.ipynb